Магистратура подготавливает специалистов в сфере построения биотехнических систем, ориентированных на автоматизацию бизнес-процессов в медицинской сфере и сфере медико-биологических исследований. Объектами профессиональной деятельности выпускников являются информационные процессы и системы, биотехнические системы и технологии. Задачами профессиональной деятельности выпускников являются: организация и выполнение процесса исследования прикладных и информационных процессов, использование и разработка методов формализации и алгоритмизации информационных процессов; организация и выполнение процессов анализа и обобщения результатов научно-исследовательской работы с использованием современных достижений науки и техники; организация и выполнение процессов разработки и интеграции биотехнических систем и технологий; организация и выполнение процесса проектирования биотехнических систем и технологий; организация и выполнение процесса разработки оригинальных алгоритмов обработки информации в биотехнических системах. Особый акцент делается на междисциплинарном подходе к формированию интеллектуальных моделей, методов и алгоритмов анализа разнородных данных и процессов.